抽检发现的主要问题有：一是检出微生物污染食品518项次，占不合格食品总数的39.24%；二是检出非食用物质不合格食品297项次，占不合格食品总数的22.50%；三是检出其他污染物不合格食品197项次、占不合格食品总数的14.92%；四是检出超范围、超剂量使用食品添加剂食品187项次，占不合格食品总数的14.16%；五是检出农兽药项目不合格食品65项次，占不合格食品总数的4.92%；六是检出质量指标不合格食品54项次，占不合格食品总数的4.09%；七是检出重金属污染食品2批次，占不合格食品总数的0.15%。